Deggendorf Institute of Technology

Life Science Πληροφορική, M.sc.

Η τεχνολογία Next Generation Sequencing (NGS) παράγει μεγάλες ποσότητες δεδομένων σε πολύ σύντομο χρονικό διάστημα. Η ανάλυση και η κατανόηση του ανθρώπινου γονιδιώματος, του επιγονιδιώματος και του σχετικού μεταγραφώματος είναι μια αυξανόμενη πρόκληση. Είναι επομένως σημαντικό να δημιουργηθεί μια λειτουργική και ανθεκτική διεπαφή μεταξύ βιολόγων, χημικών, γιατρών και φαρμακοποιών, καθώς η έρευνα στις επιστήμες της ζωής δεν πραγματοποιείται μόνο στο εργαστήριο. Ο όγκος των δεδομένων που δημιουργείται κατά την αποκωδικοποίηση ανθρώπινου, ζωικού ή φυτικού γενετικού υλικού, για παράδειγμα, πρέπει να υποβληθεί σε επεξεργασία και να συσχετιστεί ώστε να είναι χρησιμοποιήσιμο: Αυτό είναι το καθήκον της πληροφορικής της βιοεπιστήμης.

Η βιοϊατρική έρευνα χρησιμοποιεί επί του παρόντος μια μεγάλη ποικιλία αναλύσεων που βασίζονται σε υπολογιστή για τον εντοπισμό και την ανάλυση γονιδίων που είναι προγνωστικά για την πρόγνωση ή την ανταπόκριση στη θεραπεία μιας νόσου (εξατομικευμένη ιατρική και μοριακή διάγνωση). Η ανάλυση και η αξιολόγηση αυτών των συνόλων δεδομένων απαιτεί καλή γνώση των ιατρικών και επιστημονικών βασικών στοιχείων σε συνδυασμό με τη γνώση της επιστήμης των υπολογιστών προσανατολισμένη στις εφαρμογές. Είναι ακριβώς αυτές οι βασικές δεξιότητες που διδάσκονται εντατικά και με τρόπο προσανατολισμένο στην εφαρμογή στο μεταπτυχιακό πρόγραμμα Life Science Informatics.

Η πρόκληση της αξιολόγησης των δεδομένων NGS δεν είναι να διαβάσουμε την «αλληλουχία γραμμάτων» του γενετικού μας υλικού (DNA και RNA), αλλά μάλλον να κατανοήσουμε τη λειτουργία, τη ρύθμιση και την αλληλεπίδραση των γονιδίων, το «ιερό δισκοπότηρο» της γενετικής.